W sytuacji gdy chcesz dokonać optymalizacji lub naprawy tabel w bazie danych swojej strony WWW, zaloguj się do panelu phpMyAdmin , po czym w kolumnie po lewej stronie kliknij w nazwę bazy danych tak aby załadował się widok jej struktury.
Następnie na dole strony pod listą tabel kliknij zaznaczenie wszystkich tabel, po czym z rozwijanej listy w zależności od tego jaka akcję chcesz wykonać wybierz: Optymalizuj tabelę lub Napraw tabelę. W zależności od ilości oraz rozmiaru tabel proces ten może zająć od kilku sekund do nawet kilku minut.